Kuroba Kaito, gizemli bir şekilde ölen babasının etkisinde kalarak sihirbazlığa merak salmış 17 yaşında bir lise öğrencisidir. Babasının ölümünden sekiz yıl sonra, Kaito evlerinde babasının gizli bir odasını bulur. Fantom Hırsız'ın aletlerini ve giysilerini bulur. Ayrıca babasının bir cinayete kurban gittiğini öğrenir. Kaito babasının katilini bulmak için Fantom Hırsız rolüne soyunur.